多数强直性脊柱炎患者有关节病变大多最先出现骶髂关节炎，早期病变处出现臀髋部或腰背部疼痛、发僵，特别是久卧或久坐时明显，翻身困难，但活动后减轻。疾病早期疼痛多在一侧呈现间断性，数月后疼痛多在双侧呈持续性。随着病情的进展，关节疼痛减轻，病变由骶髂关节向腰椎、胸腰椎发展，则出现相应部位疼痛、活动受限或脊柱畸形。

强直性脊柱炎在脊柱炎出现之后，会侵犯全身多个系统，比如心血管系统、呼吸系统、神经系统等，导致多种疾病的伴发，比如动脉瓣关闭不全、心绞痛、结膜炎、虹膜炎、慢性中耳炎、脊髓压迫症等等。