卵巢畸胎瘤应选择手术治疗，手术范围可选择患侧附件切除、患侧畸胎瘤剥除或者是同时对侧的卵巢活检，手术方式可以选择腹腔镜或者是开腹。根据手术中所见初步判断畸胎瘤的良恶性，疑为恶性肿瘤时应尽快送冰冻病理检查。恶性畸胎瘤还应尽量行完整的分期手术，术中全面探查盆腔、切除大网膜和腹膜及淋巴结活检，了解肿瘤浸润的范围和各脏器组织受累的程度。