医学上一般将肛裂分为 3 期，初发期、慢性期、合并症形成期。患者可以根据排便时出血量和疼痛的程度，来判断病情是否严重，一般慢性肛裂长期不治愈就是很严重的了，就需要手术治疗。

初发期一般只有肛门口周围表皮的一点损伤，其他的部分都是正常的，具体表现为排便时轻度疼痛、出血。 慢性期就是肛裂长期不愈，肛门裂口周围可以看见多余的皮肤赘生物，医学上称为哨兵痔或者前哨痔，每次排便前都会有剧烈的疼痛、出血，有时还可以看见一些黄色的脓性分泌物。

并症形成期是出现哨兵痔、瘘管、肛乳头瘤等症状。当肛裂的地方出现哨兵痔，裂口引流不通畅，大便聚积，就容易感染形成脓包，最后导致瘘管。同时由于肛门的反复炎症刺激，肛门裂口内侧也会出现多余的增生物，医学上称之为肛乳头瘤，前哨痔、瘘管、肛乳头瘤被称为肛裂的三联征。