霉菌性外耳道炎以局部治疗为主，首先需要清洁外耳道内的霉菌团块、干痂、分泌物等，保持外耳道干燥，需要到医院耳鼻喉科专科，在耳内镜下配合专用工具才能够清理干净。

然后应用广谱抗真菌药物涂耳，可配合微波治疗，加速干耳及药物的吸收，待获得真菌培养结果后，应尽快选用敏感的抗真菌药物，病情严重者要静脉给予抗真菌药物。由于霉菌感染容易反复发作，请进行规范的治疗，治疗期间避免耳道进水及不洁采耳，不进食海鲜及饮酒。