目前红斑狼疮的病因还不是特别明确。

一般认为是由遗传、环境、雌激素水平、药物等多种因素综合作用于机体，引起免疫紊乱，从而导致本病的发生。研究发现，与红斑狼疮发病直接相关的因素有，紫外线使皮肤上皮细胞出现凋亡，新抗原暴露而成为自身抗原，以及感染等；

还可能有关的因素为肼屈嗪、异烟肼这些药物以及食物色素、染发剂、芹菜、无花果、蘑菇、烟熏食物、心理压力等相关；还可能与一些烟草、氯化乙烯、石棉、免疫接种等因素相关。