北京中医医院大外科为国家中医药管理局区域中医（外科）诊疗中心、国际跨学科子宫内膜异位症中心合作单位、北京中西医结合肿瘤外科专业委员会主任委员单位、北京医师协会手术技艺研究会副主任委员单位、全国造口伤口联盟副主席单位、中国中西医结合学会普通外科专业委员会常委委员单位、北京肿瘤学会结直肠专业委员会常委委员、北京抗癌协会肝胆胰常委委员单位。

并下设首都医科大学北京中医医院西医外科以及中医外科教研室，负责首都医科大学、北京中医药大学本科生、研究生及留学生的教学和培养，还承担北京市住院医师培训任务，面向全国开展肿瘤微创外科技术等各类培训班，每年培养大量的实习医生和进修医生学习。拥有3D腹腔镜等一系列先进的医疗设备，能够广泛开展消化道肿瘤等重大疾病的微创手术治疗，与此同时又保留了传统中医外科的治疗优势，传承赵炳南等名家学术思想，临床工作中应用大量院内制剂及中医特色诊疗技术，开展中西医结合治疗各种外科疾病，同时随着疑难重大手术量的迅速增加，探索将祖国医学的理法方药融入重大手术围手术期诊疗中，在快速康复中探索中西医结合的综合诊疗模式。将专科建设成为具有深厚学术传承，又独具诊疗特色、不断创新技术、又融合现代外科先进手术技艺的中西医结合外科。

全面发展肿瘤外科、血管疮疡科、乳腺科、泌尿外科等亚专业，在全国基层综合医院及中医院发扬中西医结合外科学术思想，开展手术技艺培训以及全国学术研讨会，推广中西医结合外科理念，先进的诊疗方法及手术技术，逐步在全国形成较大影响力。