扁平疣和跖疣都属于病毒感染的疾病，是由人乳头瘤病毒感染导致，但是这两者从临床表现是有一定的区别的。

扁平疣通常是粟粒大小的扁平丘疹，表面光滑，通常是淡褐色或者肤色，皮损都是散在分布，有同行反应，就是搔抓后会出现串珠样分布的皮损，一般没有自觉症状。

而跖疣通常是皮损刚开始发生是角化性的小丘疹，表面粗糙，呈灰黄色或者灰褐色，周围稍高，增厚的角质环，用小刀削去角质层，可以看到乳白色的角质软芯，容易出血，形成小黑点。

两者的发病部位也不一样，扁平疣好发在颜面、手背等暴露部位，而跖疣好发在足趾部位。