鸡眼和跖疣是有明显的区别的，两者的发病原因不同，鸡眼主要是局部长期受挤压，还有摩擦导致的角质层异常增生。而跖疣主要是由于人乳头瘤病毒感染导致的一类传染性的皮肤疾病。

两者发病部位也不相同，鸡眼通常好发在脚掌前中部，小趾外侧和拇趾内侧缘，也可能发生在脚跟跟手部，而跖疣通常好发在脚掌部。

两者的临床表现也不一样的，鸡眼淡黄色的角质增生，圆形或椭圆形，表面光滑，跟皮面平齐。跖疣通常是一些表面粗糙，边缘比较高的角质环，中央是比较凹陷，有些是表面凹凸不平。