鹅口疮和马牙是完全不同的症状，又因马牙是由于牙釉质异常堆积在牙龈表面，形成硬包块，而鹅口疮是真菌感染，多为白色念珠菌感染，位于口腔的黏膜部位，如上颚、舌苔、口腔内部两颊。

另外，发生的时间不同，马牙主要在出生时，在牙床上可以看到。还有鹅口疮并不是刚刚出生就有的，属于条件致病菌，特别是有免疫力低下、抗生素使用以及真菌感染情况。

另外，临床表现也不同，因为马牙是在口腔内牙龈生长，牙齿的部位会摸到比较硬的包块，类似于牙齿组织，在触碰时没有任何疼痛感，鹅口疮位于其他的口腔黏膜，表现为白色斑块，用棉签可以轻轻刮掉，然后会使局部皮肤有疼痛不适的感觉。