肝癌早期，甲胎蛋白不一定会升高，首先肝癌分为原发性肝癌和转移性肝癌，原发性肝癌包括肝细胞癌和肝内胆管细胞癌两个大类，只有肝细胞癌可以表现为甲胎蛋白的升高。

对于肝内胆管细胞癌，并不会出现甲胎蛋白升高。更多的见到糖类抗原19-9的升高。对于转移性的肝癌，从其他的原发肿瘤部位转移至肝脏所致，常见的有肺癌肝转移和胃癌肝转移的，这些转移性的肝癌一般不出现甲胎蛋白的升高。

第二，即使是对于原发性的肝细胞肝癌，在早期也并不一定会出现甲胎蛋白的升高，肝癌在早期更多地需要依赖影像学检查来发现。