有一部分的癌症早期的患者就可以出现癌胚抗原指标的升高，但是并不是所有的癌症早期患者都会出现癌胚抗原的升高的，有一些患者即使已经发生了远处转移，病情达到了晚期，癌胚抗原仍在正常的水平。

目前的肿瘤标记物特异性和敏感性都还不够高，因此并不可以与癌症的发生与否直接划等号。有些患者出现癌胚抗原升高，也并没有发生恶性肿瘤，而是因为体内一些良性病变而导致的。