扁桃体发炎，发烧到39度5，这种情况下，首先需要进行退热治疗，可以使用退热栓，同时配合物理降温，患者还需要进行对症抗炎治疗，使用抗生素就可以逐渐好转。

扁桃体发炎，主要是由于身体的免疫力和抵抗力低下，以后细菌感染所引起的症状。在临床上，多见于溶血性链球菌，会引起患者出现突然高热，一般体温在38度以上，同时还会伴随着咽喉部剧烈肿胀、疼痛以及吞咽痛。

首先需要到医院检查一下电子喉镜，血常规就可以确诊，在治疗上则需要进行对症抗炎治疗，因为是细菌感染，可以口服或输液，青霉素类抗生素，同时配合使用雾化吸入，体温升高到38度以上，则需要进行退热治疗。