肉芽肿的治疗与肉芽肿的类型息息相关，肉芽肿分感染性肉芽肿、异物性肉芽肿和结节病性肉芽肿。感染性肉芽肿的治疗首先要控制感染。同时，要彻底的清除坏死的组织，必要时切除坏死的组织，清创换药，同时辅以消炎，让新鲜的肉芽组织生长出来才能治愈。

异物性肉芽肿需要采取手术的方式取出体内的异物，同时加强伤口的清创换药才能治愈。结节病性肉芽肿一般比较少见，一般为一种病因不明的全身性疾病，需要对症治疗。