肠扭转和肠套叠鉴别诊断，主要是以下方面。

第一，发生的人群肠套叠大多数发生于婴幼儿，特别是一岁之内的婴儿，而肠扭转大多数见于习惯性便秘的老年人，既往过去有类似发作的病史。

表现症状不同，肠套叠一般情况下腹痛、呕吐症状比较明显，有典型的粘稠果酱样粪便，或者是鳕鱼粘液混合状的胶冻样粪便，可以触及腹部的包块。而肠扭转大多数为中下腹急性的腹痛，持续性胀痛，无排气排便，明显腹胀是突出特点，并且腹胀呈不对称性。

治疗方法不同，肠套叠对于小孩一般是选择非手术疗法，大多数是空气灌肠复位，非手术治疗失败，可以采取手术治疗。而对于肠扭转，一般的治疗原则，大多数需要采取急诊手术疗法。