肛瘘作为肛肠科常见疾病，如果是简单的肛瘘，可以通过视诊和触诊来进行判断。如果是高位的复杂性的肛瘘，通过单纯的视诊和触诊无法准确检查，那么可能需要借助仪器。目前来说，最准确的检查方法推荐核磁共振，核磁共振列为肛瘘检查的金标准，有利于判断瘘管的走形和感染到的位置。