怀孕40天自然流产能否流干净，这个不确定，每个人的情况不一样，有的人会流干净，流产之后出血量很少，少于月经量，行超声检查，宫腔内未见残留影像。

有的人自然流产后会有阴道出血量多或者淋漓不尽的出血，超声提示有宫腔残留，必要时行清宫治疗，当出现自然流产后，应观察阴道出血情况。

如果出血不多，少于月经量，可一周后复查超声，看是否有宫腔残留，如果出血多，随时医院就诊，流产后还要注意外阴清洁，预防盆腔炎，预防继发不孕。