月经期过后两天同房是不会怀孕的，因为月经刚干净两天，在月经周期当中是属于早卵泡期，子宫内膜也是属于增生早期，都不适宜怀孕。因为是早卵泡期，卵子才刚刚开始发育，发育还远远没有达到能够发育成熟，排出的程度，所以是不会有成熟的卵子形成并排出的，自然也不会形成受精卵。

另外子宫内膜在增生，早期内膜比较的薄，根本不适宜受精卵的着床，所以在月经干净后两天同房是安全的，基本上是不会怀孕的。