空囊不一定会自然流产。流产分为不全流产、完全流产和稽留流产，有的人可能在空囊胚胎停育之后，会出现腹痛、出血的现象，出现流产，也有的人在胚胎死亡之后，滞留在宫腔不能及时排出，表现为早孕反应消失，有阴道出血，或者没有任何症状，多在检查时被发现。

如果胚胎停育时间比较长，不建议等待自然流产，胚胎长时间不能排出，有可能会出现胚胎机化，与子宫壁紧密连接，导致刮宫困难，还有可能会出现凝血功能障碍，弥散性血管内凝血等情况。