首先，治疗雌激素低与巧克力囊肿是没有直接关系的，所以说激素低也不会导致巧克力囊肿上涨的。巧克力囊肿主要是因为炎症导致的，患有巧克力囊肿的女性，需要在医生指导下尽快的，一般采用药物或者是手术的方式进行，不然很会容易排卵，进而导致不孕不育的。

巧克力囊肿超过五个厘米，可以在医生的建议下采用手术治疗，有怀孕需求的巧克囊巧克力囊肿患者在预后要尽快的怀孕，这样也可以更好的防止复发。还要在月经期间避免做比较消耗体力的运动，也不要吃太过辛辣刺激性的食物，要避免熬夜。