男性生殖器官上长痘痘，很有可能只是普通的细菌感染所引起的，或者是皮肤感染所引起的。这个现象比较轻微，可以通过药物或者是局部应用抗生素达到尽快缓解和治愈的效果。

但是也有可能是因为病人性生活不规律，接触了不洁的性事导致的。由于病毒引起的性传播性疾病，像尖锐湿疣或者是生殖器疱疹，这个是比较严重的。

再就是可能病人出现毛囊炎的疾病，因为毛囊炎也会导致男性生殖器官长痘痘的现象。同时如果男性生活不规律导致出现上火，也会发生这个现象。

所以男性生殖器官上长痘痘，应该及时调整生活作息，保持饮食规律，严重的需要到医院进行检查，以明确病因，再进行治疗。