甲状腺功能减退症对人体的危害，主要是可以导致低代谢症候群的症状和器官损伤。比如在神经系统可以导致出现记忆力、注意力、理解力和计算力的减退，可以出现嗜睡、反应迟钝、精神抑郁或者是烦躁，可以出现小脑功能的障碍，重的患者甚至可以导致粘液性水肿性昏迷。

累及到心血管系统会导致心动过缓、心音低弱、脉压差减小、心排血量减低、可以出现心脏扩大、心包积液、重的可以出现粘液性水肿性心脏病。可以导致患者出现肌肉的无力、厌食、腹胀、便秘，可以出现贫血、性腺功能的减退、高泌乳素血症、男性可有阳痿和精子的缺乏、女性患者可有月经过多、经期延长、闭经或者是不孕不育。