窦性心动过缓的原因有生理性的和病理性的，生理性的常见于健康的青年人，运动员，长期从事体力活动的人及睡眠状态。病理状态的包括严重缺氧、低温、甲状腺功能减退、颅内的疾病、血管迷走性晕厥等。

另外，窦房结病变和急性下壁心肌梗死的患者也会出现窦性心动过缓，应用某些药物，如抗胆碱药物、胺碘酮、倍他受体阻滞剂、洋地黄或非二氢吡啶类的钙通道阻滞剂如地尔硫卓等也会出现窦性心动过缓。无症状的窦性心动过缓通常不需要治疗，如果窦性心动过缓且有晕厥或黑曚等现象，需考虑心脏起搏治疗。