儿童蛛网膜囊肿手术以后会不会有后遗症，取决于这几个方面。

第一个，做手术之前，症状明不明显，有没有很严重的脑损伤存在。

第二个，囊肿的部位，囊肿的大小，还有手术的方式和手术术后的恢复情况。

如果手术过程都很顺利，手术以后都恢复好，没有明显的并发症，一般单纯手术是不会造成新的明显的其他后遗症出现。但是如果术前已经造成了比较严重的脑组织损伤，出现了明显的临床症状，有部分症状有可能术后不能够完全恢复，会出现相关的后遗症。

第二方面，术后如果出现了像颅内出血、颅内感染这些并发症，可能导致一些新的神经功能障碍，从而出现各种各样的后遗症，像脑积水、癫痫，像做分流管以后的分流管依赖，囊肿的复发，或者是发育落后、眼球运动的障碍等各种各样的后遗症的可能性。