女性小腹两侧隐隐作痛最常见的原因是盆腔炎，所谓盆腔炎是指盆腔的一种炎症反应，最常见的是子宫内膜的炎症，有部分病人还存在有输卵管炎和卵巢的炎症。有的时候是一种阴道的下行感染向上延续造成的，如果延续到子宫两侧的输卵管、卵巢，会造成小腹两侧隐隐作痛的症状，而且这种症状一般是一种慢性的，有一部分病人是急性发作的，会突然很疼，伴随有分泌物的增多、下腹痛，还有发热的症状，这是一种急性发作时候的情况。

有部分病人可能是一种慢性的盆腔炎，每个月总会有几天很不舒服，总会有一点隐隐作痛，分泌物可能也会增多，但是这种疼痛是一直持续存在的，而且没有伴有急性的发热，这可能就是慢性的一种盆腔炎。

如果是盆腔炎，需要使用抗生素进行规范的治疗，另外可能还有一些辅助的治疗，才能慢慢痊愈。

另外最常见的肚子疼症状是痛经，还有一部分病人是因为子宫内膜异位症，所谓的子宫内膜异位症是指子宫内膜没有被于子宫腔内，它位于子宫以外的地方，比如输卵管、卵巢上，在每个月来月经的时候，甚至不来月经的时候，病灶在局部出血，都会造成小腹两侧隐隐作痛，这种处理起来比较复杂。