神经官能症造成的脑功能紊乱，自然会影响到全身各个脏器功能的正常与否，对于中枢神经系统本身来说，影响也是巨大的。

对于中枢神经系统影响主要表现在会出现头晕、头痛、失眠，对于疼痛，据现在的研究观察，它们的调节通路和情绪的调节通路是相同的，释放的神经递质基本上也是5-羟色胺和去甲肾上腺素，所以在神经功能紊乱的时候，自然就可以出现一些疼痛的表现。

根据临床观察，在11种容易引起神经官能症的症状当中，疼痛就占了5种，包括关节痛、头痛、躯干的疼痛等，所以神经官能症是可以引起全身性疼痛的。