肛瘘的手术是切开根治术，就是把整体的病灶一定要切除干净，同时把感染的内口要彻底地清除，术后要进行常规换药，一般要三周左右，一些浅表、单一的肛瘘，可能创口就会完全愈合。

但对于一些深部的高位肛瘘，换药的时间和恢复时间更长一些，一般需要一个多月，尤其一些多间隙的肛瘘，需要术后的冲洗、换药，可能需要一到两个月左右时间。