结肠炎是一类疾病，主要是感染因素和非感染因素引起的。

结肠炎主要是慢性结肠炎，感染因素主要包括细菌，像菌痢，可以长期慢性存在于肠道里的病原微生物引起的慢性炎症，通过大便培养就可以准确的发现，根据培养选择药敏可以进行针对性有效的治疗。

另外一类是非感染性的，主要是自身免疫性的，包括溃疡性结肠炎、克罗恩病、白塞氏病、非特异性的其它自身免疫病，这些都是自身免疫力失去控制，把肠子的一些抗原作为靶标，直接攻击小肠、大肠，引起溃疡、糜烂、出血。