结肠炎能否自愈完全取决于病因是否能去除。

如果是感染性的，包括细菌、寄生虫、病原体，随着机体抵抗力的增加，或者其他的一些机缘，机体去除了病因之后，是完全可以自愈的。

而自身免疫性肠炎，自己免疫力攻击自己的肠道，这种情况下大部分只是通过药物来控制，但也有一些人，随着年龄增长，免疫力发生一些平衡上的改变，尤其女性绝经之后，一些自身免疫病会慢慢得到自我缓解，包括狼疮，随着时间推移，存在自愈的可能性，但是发生几率相当低。