小儿脑积水多由颅内结构发育异常引起的脑脊液吸收障碍，长期的脑室扩大会影响小儿神经系统发育。

如果只是轻微的脑积水，神经系统发育比较完善，通过积极的治疗，大部分小儿是可以生活自理，甚至与正常小儿对比无明显差异，一般不会有比较明显的后遗症。

但是有一部分患者病情比较严重，导致瘫痪、智力下降、大小便失禁等，有可能导致后遗症的出现，比如头痛、恶心、呕吐、行走不稳、视物模糊，还有一些患儿会出现复视、眩晕，甚至癫痫发作。

长期的颅高压，患者头颅增大，神经发育缺陷，可出现俗称的“大头娃娃”，手术一般不会有太好的效果，这种后遗症是永久的。