目前机体产生癌症的原因都不是特别清楚，关于胆管癌也是类似，通常可以归类为内因和外因共同作用导致了胆管癌。

对于胆管癌的外因，比方说各种感染、炎症，比方说胆管结石或以前的胆道蛔虫，硬化性胆管炎或者是胆管扩张症，长期的感染或者炎症刺激导致局部的病变。另外还有患者的体质，还有一些生活或者饮食习惯可能也是诱因。

对于它的内因，可能是一些基因的改变或者是体内免疫微环境的改变，这种外因和内因共同作用导致胆管癌的发生。