子宫内膜异位症是一个非常玄妙的疾病，它的发病原因有很多种假说，目前比较得到公认的是叫经血逆流学说，就是正常女性都有都来月经，来月经之后经血除了从宫颈、阴道流到体外之外，还有一部分经血就会通过输卵管流到盆腔里。很多女性都会有这样的事情发生，流到盆腔里的经血绝大部分女性就会被自体吸收，而不会留下任何不适，或者留下任何的病灶。

但是有些女性这个土壤就适合于这个种子发芽，那么流到盆腔里的这些经血就没有被女性吸收，残留在盆腔里，残留在盆腔里之后这些经血里的子宫内膜就生长活跃，长起来了。长起来之后这些内膜也一样，跟宫腔里的内膜是一样的，定期脱落、定期出血，不断脱落出血，经过几年时间的累积之后，就形成了。

如果形成了包块，如果包块在卵巢上这是最常见的，叫卵巢囊肿。子宫内膜异位卵巢囊肿叫巧克力囊肿，因为它的内容物是经血，陈旧的经血是巧克力样的。如果在盆腔的其他部位，非卵巢部位，那么就会形成一些质硬的结节，尤其在后穹窿的地方，那么这种结节在同房的时候一碰到，就会引起女性非常的疼痛，这是子宫内膜异位症的形成原因。