尿道感染一般是由于细菌、病毒、真菌或者是多种寄生虫引起的尿路感染。尿道感染一般95%以上是由单一细菌引起的。临床上大多数尿道感染的病原菌是大肠埃希菌，也就是大肠杆菌。其尿道感染中的大肠埃希菌与粪便中分离出来的大肠埃希菌是同一种菌型，多见于无症状的菌尿或者是没有并发症的尿路感染；而变形杆菌、产气杆菌、克雷白肺炎杆菌、绿脓杆菌、粪链球菌等见于再感染、留置导尿管以及有并发症的尿路感染；那么糖尿病人或者服用免疫抑制剂的病人以及肾移植后的病人尿道则容易被白色念珠菌、新型隐球菌感染；而多种细菌感染一般见于留置导尿管、神经源性膀胱、结石、先天性畸形以及阴道、肠道以及尿道瘘等等。