扁桃体结石多发生在扁桃体的上隐窝之中，此处由于长期阻塞的状态，分泌物引流不畅，容易导致干酪样物积聚，导致不易溶解的钙、镁等无机盐沉积而形成结石。

当然，虽说扁桃体结石的位置主要在扁桃体的上隐窝之中，但由于各种因素的影响，除了吞咽、呼吸困难的症状之外，还可以出现耳痛、口臭的症状，影响的范围是比较大的，会影响患者的生活质量，所以建议扁桃体结石的患者，要及时到医院进行相关的检查，在医生指导下进行治疗。