目前多囊卵巢综合症的病因尚不明确，遗传、营养、环境、精神因素等都是可能的病因。
第一，如果母亲确诊多囊卵巢综合症或有月经稀发、父亲有秃顶、家族中有糖尿病人，患多囊卵巢综合症的风险则相对增加。
第二，肥胖与高能量饮食加重排卵障碍与高雄激素血症。
第三，存在于一次性塑料杯及装修地的环境化合物如双酚A、二嗯英会干扰内分泌系统，引起排卵障碍或者胰岛素抵抗的表现。
第四，长期抑郁、焦虑、紧张也可以促进这个疾病的进展。